随着肠道微生物组学功能日益受到重视，如何在体外模拟体内环境系统性研究肠道细胞-微生物-免疫-营养四者之间的相互作用成为摆在科学家面前的一道难题。在肠道中宿主 - 环境相互作用的研究将受益于维持组织结构但允许严格的实验控制的培养系统。

近日发表在Cell的一篇文章表明，来自哈佛大学的研究团队设计了一种微制造的器官培养系统，其能够保持小鼠肠道的正常多细胞组成，并具有腔流以控制扰动（例如微生物，药物）。它能够研究不同肠道组分（免疫，神经元等）的短期反应。研究者首先聚焦在对诱导Th17或RORg + T调节（Treg）细胞对体内细菌的早期反应。转录反应部分重现体内变化特征，但这些微生物引发神经元特异性基因集表达上相反的变化，特别是伤害性神经肽的。研究表明，微生物可激活感受神经元，并与RORg + Treg诱导相关。结肠RORg + Treg频率在缺乏TAC1神经肽前体的小鼠中增加并且在辣椒素饮食喂养的小鼠中减少。因此，肠道神经系统的不同接合可能参与对微生物的分叉促炎或抗炎反应。