原发灶不明转移癌（cancer of unknown primary，CUP）是世界范围内发生频率最高的十大癌症之一，并且是造成癌症患者死亡的第四大常见原因。目前国际上对CUP没有统一的定义，普遍认为：组织学上明确为转移癌，经过全面的病史询问，完整的体格检查，包括血检，尿检、组织病理学检测、X射线、CT等仍未找到原发部位的癌症。在目前发现的实体瘤中，CUP约占总数的3%~5%，但是目前国际上对于CUP的治疗众说纷纭，尚无统一和有效的治疗方案，这直接导致CUP预后较差，中位生存期仅6-9个月，因此对于CUP患者，及时明确原发灶，从而合理地选择治疗方案对提高疗效、改善预后、延长生命周期是十分重要的。
对于CUP的诊断而言，传统的方法（包括免疫组化、核磁共振等）只能够鉴别30% CUP的原发灶位置。近些年，随着精准医疗的发展，一些分子生物学方法逐渐被应用到疾病诊断中。基于基因表达预测的精准医疗方法被应用于CUP的诊断中，能够明显将诊断准确率提升至70%~90%，如下图一所示，但是这一方法仍存在价格昂贵，RNA样本也在手术操作时被破坏等缺点。
新的精准医疗检测方案的提出，对CUP的诊断治疗至关重要。已有研究发现，DNA甲基化能够在不改变DNA序列的基础上调节基因的表达，影响DNA和蛋白相互作用，调节细胞分化等。更重要的是，DNA甲基化可以抑制抑癌基因的表达（如CDKN2A, CDKN2B, MLH1, MGMT, CDH1等），从而促进癌症的发生发展。但是由于数据量的不足，DNA甲基化模式研究局限于部分疾病的少量特定基因组位点。而在2012年，科学家们通过高通量测序的方法，首次研究了1000多例患者样本的1505个CpG位点，绘制了DNA甲基化图谱，鉴定出24种不同肿瘤类型的特定指纹。在此基础上，2016年的Lancet Oncol上报道提出了一种基于表观遗传学的CUP诊断方法——EPICUP，通过检测CUP组织的DNA甲基化情况，与甲基化指纹图谱对比预测原发肿瘤灶位置，这一方法的预测成功率达到了87%~100%（如图一）。
综上所述，精准医疗分子诊断方法的发展，对于癌症患者的诊断治疗、预后提升是极其重要的，而其中，DNA甲基化分子检测平台（如EPICUP）将成为癌症临床诊断中不可或缺的关键性技术之一。

图一 各检测方法的检测效果